Bei "Formate im Inhaltsverzeichnis" legst Du fest, welche (Absatz-)Formate ins Inhaltsverzeichnis einbezogen werden.
Bei "Format" legst Du fest, wie die Einträge (im Inhaltsverzeichnis! Nicht in den tatsächlichen Headlines!) dargestellt werden.
Der Charme dabei ist, dass Deine Headlines nach wie vor in Versalien bleiben können, während die Darstellung im Inhaltsverzeichnis ohne Versalien daherkommt - ohne dass Du nachträglich dran rumbasteln musst.
Ein zusätzliches Zeichenformat ist da völlig unnötig und im Übrigen auch sinnlos - sowohl bei "Formate im Inhaltsverzeichnis" als auch bei "Formate" kannst Du nur Absatzformate auswählen, und folglich wird alles, was Du mit einem Zeichenformat nachbearbeitet hast, bei der nächsten Aktualisierung unweigerlich überschrieben - samt Zeichenformat. Du machst es Dir damit also nur unnötig schwer.