In erster Linie sind das SEO-Themen

Vor vielen Jahren war es vorteilhafter, wenn man Subdomains verwendete, weil google die Suchergebnisse pro Domain begrenzte und Subdomains wie eigenständige Domains behandelt wurden. So konnte man mehr Ergebnisse in den Fundstellen platzieren.

Irgendwann wurde das abgestraft, so dass mittlerweile meist mit Verzeichnissen gearbeitet wird.

Dazu kommen noch viele kleinere Details, die je nach Ziel im Einzelfall mal das eine, mal das andere sinnvoller erscheinen lassen.