Unter Systemeinstellung müsste eigentlich gehn. Hab ich grad auf einem anderen Mac mit 10.11.5 probiert.
Es darf sich dabei aber nicht um iCloud Mail handeln und es muß ein IMAP Account sein.
Hab Posteo.de damit geht das.

Was Notizen App angeht muss die Seitenleiste bzw. Ordner eingeblendet werden.
Menu > Darstellung > Ordner einblenden.
Wenn der Mail Account mit Notizen verküpft ist taucht das denn da als Ordner auf.
Also im Prinzip wie auf dem iPhone.