Das würde ich (so) nicht tun - zumindest die Datei "Bookmarks.plist" sollte man behalten …

… darin sind nämlich - nomen est omen - alle Lesezeichen gespeichert.

Zudem würde ich noch folgende Dateien und Verzeichnisse löschen, um das Safari-Problem zu beheben:
  • ~/Library/Caches/com.apple.Safari
  • ~/Library/Containers/com.apple.Safari* (mehrere Verzeichnisse)
  • ~/Library/Preferences/com.apple.Safari* (mehrere Dateien)
  • ~/Library/Saved Application State/com.apple.Safari.savedState (Alias)
  • ~/Library/WebKit/com.apple.Safari
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Christian, MacFix.