Wenn sie über iPhoto gesynct werden: ja. Je nach Modell etwas mehr (nicht-Retina iPad) oder weniger (Retina). Du kannst aber auch meine…

… hier schon bis zum Erbrechen lobgepriesene Lieblinsgapp "Documents" [apple.com] nehmen, und dann einen ganzen Schwung Fotoordner syncen (auch ganz ohne iTunes), dann bleiben die Bilder unberührt. Auch beim Sync über Dropbox etc. wäre das der Fall.