Das sind alles Bestandteile des Unix-Systems und normalerweise nicht sichtbar.

Es kann nach einem Update mal vorkommen, das einer dieser Ordner nicht wieder die 'hidden flag' bekommt und dann sichtbar bleibt.

Mit sudo chflags hidden /Pfad/zum/Ordner sollte der Ordner wieder unsichtbar werden.

Moeglicherweise erst nach einem Neustart...