ich kann mir das nicht wirklich erklären..

Wie sieht es aus, wenn du das Preset mit fester Framerate 30fps nimmst?
Mach mal den Haken "für Netzwerkbetrieb optimieren weg"

Wie kommst du eigentlich auf 30fps? Was ist dein Ausgangsmaterial? 30fps ist zwar der allgemeine Sprachgebrauch aber Kameras nehmen mit 29,97fps auf.

hat mit dem Problem nichts zu tun:
grundsätzlich sind 3000mbs echt wenig. Das wird dir beim Abspielen Komperssionsartefakte zeigen. Das solltest du nur verwenden, wenn es dafür einen triftigen Grund gibt