Hast Du die SMART-Tests schon gemacht?

Im Speicher-Manager kannst Du sowohl Schnelltests als auch die ausführlicheren Tests anstoßen und Detailergebnisse ansehen:
https://www.synology.com/de-de/knowledgebase/DSM/tutorial/Storage/How_to_diagnose_drives_health_status_when_receiving_bad_sector_warning
https://www.synology.com/en-us/knowledgebase/DSM/help/DSM/StorageManager/disk

Wenn Deine Platten 1:1 gespiegelt sind, dann würde ich zudem einfach mal jede Platte einzeln entfernen, damit lässt sich das Geräusch vermutlich auf eine Platte eingrenzen.