Ich habe es gerade in iThoughtsX ausprobiert, zumindest …

… »halb-händisch« klappt es dort. Sprich, man muss die enthaltenen Ordner jeweils händisch in den darüberliegenden Ordner ziehen. Immerhin lässt sich der jeweilige Ordner direkt aus der Map heraus aufrufen, so dass man nicht lange suchen muss.

Lässt man sich im Finder die Ordnerinhalte aufklappen und zieht alles in die Map, dann stimmt die Struktur leider nicht, da einfach alles in die Ebene darunter gelegt wird.

Nutze das Tool jedoch zu selten, keine Ahnung, ob man da ggf. auch die Struktur in einem Rutsch importieren könnte, sowas suchst Du ja vermutlich.