(Nicht nur) ein früherer Kunde nutzte für seine Software-Manuals Framemaker

http://www.adobe.com/de/products/framemaker.html

Als weiteren Standard durfte man wohl DocBook ansehen, da scheint aber auf den ersten Blick etwas Ruhe eingekehrt zu sein, vielleicht gibt es da auch einen Nachfolger:
http://docbook.org

Bin aber zugegebenermaßen nicht im Thema, war froh, dass die das damals intern gemacht haben.