Zum Thema Sync und Löschen: wenn du eine neue Bibliothek in Musik anlegst, wird Musik bzw. das iPhone als neue Bibliothek erkannt.
Und wie auch schon bei iTunes, wird das iPhone erst gelöscht, um dann die Daten von der neuen Bibliothek zu syncen. Man kann halt keine zwei Bibliotheken übernehmen. War schon immer so.