…deshalb kann ich auch nicht viel fachlich zu sagen, nur Mutmassen. Was mir auffällt ist, dass du da richtig fette Flächen als Leiterbahnen verwendest. Leiterbahnen haben eben auch kapazitive und induktive Eigenschaften und beeinflussen so auch die Schaltung. (wenn du danach suchen willst, der Begriff ist parasitäre Kapazität, - Induktivität und - Widerstand)

Ob das hier zutrifft weiss ich nicht, aber der Kondensator für die Taktung hat ja auch nur 10nF.

Deshalb sind Platinenlayouts für Computer auch ganz besonders anspruchsvoll.