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Das sind beides Containerformate...
... die haben einen (kleinen) Anteil an der Größe (MKV größer) aber nicht an der Qualität. Die Qualität bestimmt sich durch den Codec und seinen Einstellungen. Alleine aus Gründen der Kompatibilität wäre aber MP4 vorzuziehen. Da wir hier deine Anforderungen aber nicht kennen, einfach mal nach "mp4 mkv" googeln, die Unterschiede werden zahlreich beschrieben. -
Sind beides nur Container, die Audio, Video etc. zusammenfassen.
Die Qualität hängt davon ab, wie Audio und/oder Video codiert wurden (Codec, Bitrate, …), was völlig unabhängig vom Container ist.
Je nach Nutzergruppe ist das eine oder andere Format verbreiteter. Die praxisrelevantere Frage ist eher, was unterstützten die eigenen Abspielgerät. Da man als Apple-Nutzer ohne Zusatzprogramme mkv nicht abspielen kann, ist mp4 wahrscheinlich die bessere Wahl. -
Man kann verlustfrei von einem Container in den anderen packen.
Keine Ahnung über GUI Werkzeuge, mit ffmpeg wäre das bspw.
ffmpeg -i input.mkv -codec copy output.mp4
In der Praxis kommt es jedoch auch auf die verwendeten Codecs bzw. deren Kombination an. h.264/h.265 und AAC sollten kein Problem sein, VP9 und Opus wird wahrscheinlich nicht funktionieren.
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