Ich hatte mal sowas. Der leere Ordner hatte ein neueres Erstellungsdatum Da wurde beim syncen einfach mal angenommen, dass der neuere Ordner der aktuelle Sync-Stand wäre. Da wurden auf dem anderem Laufwerk einfach alle Daten gelöscht
Ist schon länger her, weiß auch nicht mehr welche Software das war. Seit dem bin ich beim Syncen vorsichtig.