Auf meinem MacMini hat es auch erst im zweiten Anlauf geklappt

beim ersten Versuch rödelte nur ewig der Sat-Ball. Ich habe den Rechner dann via Hauptschalter aus- und wieder eingestellt und das update erneut aktiviert ("über diesen Mac" zeigte noch Version 10.12.3 an). Da lief es dann normal und nach gefühlten 30-45 Min war alles erledigt.