Sowas würde ich nie mit einer "normalen" Finder-Kopie machen. Auf jeden fall Tool wie rsync (mac) oder robocoby (win) verwenden

beides sind "eingebaute" tools, die man mit der Kommandozeile konfiguriert. ich finde robocopy sogar einfacher (intuitiver) als rsync.

Diese tools haben den vorteil, dass man genau gesagt bekommt ob alles gut gegangen ist, was kopiert wurde und - wenn was schief gegangen ist - was das war. Ausserdem kann man im Fehlerfall *nur* die Dateien, die nicht funktioniert haben nachkopieren.

Also was du schreibst: "Ich kann leider nicht eine knappe Million Dateien händisch vergleichen" – genau dafür sind diese tools da!