Exportieren im nach hinein geht wohl nicht mehr...

aber man kann mit Rechtsklick den Container eines EyeTV-Films öffnen, indem man sich den Paketinhalt anzeigen lässt. Dann siehst du die eigentlich Filmdatei, allerdings als Transportstream.
Macht aber nichts, in EyeTV kann man ja auch beliebige QuickTime Filme öffnen.