Ist ffmpeg eine Option? Damit würde es gehen
http://superuser.com/questions/685910/ffmpeg-stereo-channels-into-two-mono-channels
ffmpeg -i stereo.wav -map_channel 0.0.0 left.wav -map_channel 0.0.1 right.wav
Installation über Homebrew oder als fertiges Binary
ffmpeg -i stereo.wav -map_channel 0.0.0 left.wav -map_channel 0.0.1 right.wav
Installation über Homebrew oder als fertiges Binary