Es gibt drei Möglichkeiten, wie Objekte aus einem Time Machine Backup ausgeschlossen werden.

1) Sie sind auf der globalen Liste, die Apple mitliefert. Das betrifft Dateien wie Logs, Caches, oder Systemdateien (wenn diese nicht mitgesichert werden sollen).

2) Du hast sie über die Time Machine-Systemeinstellungen ausgeschlossen.

3) Das "extended attribute" com_apple_backup_excludeItem ist gesetzt [macworld.com].


Die Sichtbarkeit eines Objektes spielt keine Rolle.