Du gibst Dir die Antwort bereits selber: "Das Speichern erfolgt im lokalen Netzwerk auf einem Server."

Beim direkten Speichern auf Serverlaufwerke hatte InDesign (aber auch andere Adobe-Programme) schon immer das Problem, dass Dateien beschädigt werden oder nicht mehr gespeichert werden können.

Um dies zu verhindern: Speichere die Datei direkt auf dem Server unter einem anderen Namen ab oder speichere die Datei lokal und kopiere diese danach auf den Server.
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Christian, MacFix.