Hilft dir jetzt sicher nicht, aber ich hatte mit entzücken festgestellt, dass das iPhone wusste, wo ich

am iPad zu lesen aufgehört hatte.
Aber ich musste dazu das Buch auf beiden Geräten separat laden, synchronisiert wurden die bibliothekenonhalte an sich nicht. Was für mich aber Sinn machte, da ich nicht alles überall brauchte.
Evtl. musst du den Sync via iCloud aktivieren.

Zu deiner Frage: die beiden Geräte laufen über die selbe Apple id?