Hä? iBooks Author hat ja nun mal NULL mit OS X Server zu tun. :) Die iBooks liegen ja auch schon vor, wie er schreibt. Also, so geht es:

Seit iOS 8 & Yosemite Server kann der Profilmanager von OS X Server auch iBooks und PDFs an die verwalteten iOS-Geräte pushen. Die erscheinen dann logischerweise in der iBooks-App.

https://www.apple.com/de/osx/server/features/#profile-manager

Klar könntest Du's auch über Documents machen. Ein Kunde von mir nimmt diesen Weg, da die IT zu blöd für ein gescheites MDM ist... wobei ich den Profilmanager auch nicht unbedingt als "gescheites MDM" bezeichnen würde. Aber dann hast Du die Dateien immer 2x auf dem Gerät: einmal in Documents und dann nach dem Weiterreichen via "Öffnen in…" in iBooks. Wer da nicht diszipliniert löscht, hat bald ein Platzproblem.