Hier mal mit Code:

Einmal die gleichen Funktionen, aber direkt im Div "content" eingebunden:
http://jsfiddle.net/yztvrbt9/4/

Einmal werden die Text-Inhalte per .html()-Methode in das Div "content" nachgeladen:
http://jsfiddle.net/8bpra92c/4/

Beim Nachgeladenen bekomme ich bei Klick "0" zurück, beim direkt eingebundenen dann "354"

Das "Heiße" daran: Wenn ich direkt auf die Stelle klicke, zu der gescrollt werden soll (fette Zeile "Hier will ich hin") bekomme ich bei beiden Varianten die Y-Koordinate.
Diese ist also sehr wohl bekannt, kann aber nicht "von außen" abgefragt werden bei Variante 2!